Muchas veces nos encontramos con que a la hora de clonar un repositorio desde Git mediante SSH este no utiliza el puerto por defecto y nos da error al ejecutar el comando clone, para corregir este error solo basta con ejecutar el comando de la siguiente forma:
git clone ssh://usuario@servidor.com:2222/ejemplo/proyecto.git
Espero que esta información les sea útil, saludos.