Una pregunta muy común entre usuarios de rsync es como evitar la copia de un archivo; para ello solo debemos agregar un parámetro al momento de ejecutar el comando:
rsync -avhn --exclude 'Thumbs.db' origen destino
En este ejemplo excluimos el archivo thumb.db pero puede sustituirse por cualquier archivo.
Espero que esta información les sea útil, saludos…